Une molécule est un ensemble de deux ou plusieurs atomes liés entre eux. Les atomes s'assemblent grâce à des liaisons chimiques pour former une molécule stable.

Une molécule peut être composée d'atomes identiques, comme le dioxygène (O₂), ou d'atomes différents, comme l'eau (H₂O) ou le dioxyde de carbone (CO₂). Chaque molécule possède une composition et des propriétés qui lui sont propres en fonction des atomes qui la composent et de leur organisation.

Une formule chimique indique le nombre et la nature des atomes qui composent une molécule.

Une molécule d'eau est formée de deux atomes d'hydrogène et d'un atome d'oxygène (H₂O). Une molécule de dioxygène est constituée de deux atomes d'oxygène (O₂).

Les molécules sont présentes partout : dans l'air que nous respirons, l'eau que nous buvons, les aliments, les médicaments, les plastiques et même dans les cellules de notre organisme. Certaines substances, comme les métaux, ne sont cependant pas constituées de molécules mais d'un vaste assemblage d'atomes organisés différemment.